ПОПУЛЯРНЫЕ НАНОТЕХНОЛОГИИ

Кадры

Фотогалерея

Новости

Новый метод секвенирования ДНК сохраняет расположение клеток в тканях / 22.12.2021

 

Авторы новой работы создали свою технику секвенирования ДНК с пространственным разрешением, ее назвали slide-DNA-seq.

Новый подход к секвенированию ДНК — Slide-DNA-seq — анализирует срезы неповрежденной ткани, в которых каждая клетка остается на своем первоначальном месте. Это отличает подход от обычных методов секвенирования, где клетки диссоциируются перед извлечением ДНК.

Во время использования метода авторы применили мельчайшие шарики, каждый из которых был помечен уникальным пространственным штрих-кодом и прикреплен к специально подготовленным предметным стеклам, для захвата ДНК из ткани.

«Каждый шарик размером с клетку. Вместе они похожи на пиксели на камере, которая делает снимки геномных изменений в каждой клетке ткани», - отмечает Фэй Чен, сотрудник Института Брода.

После фиксации геномных изменений исследователи использовали метод Slide-seq на основе РНК, его разработали еще в 2019 году. В нем используются профили экспрессии генов, чтобы определить и распознать типы и подтипы клеток в срезе ткани.

«Мы можем использовать одни и те же  шарики для захвата транскриптома из каждой клетки, а также объединить эти два измерения в мультимодальное изображение»,- говорит Фэй Чен, сотрудник Института Брода.

Иначе говоря, исследователи могут видеть изменения как в ДНК клеток, так и в экспрессии генов.

Исследователи применили эту технику к модели метастатического рака у мышей, а также к образцу первичной опухоли у пациента с колоректальным раком. В каждой ткани исследователи смогли идентифицировать субпопуляции раковых клеток в различных регионах, соответствующих уникальным эволюционным путям генома и состояниям экспрессии генов, - пишет hightech.fm.


Другие новости по теме:
20.01.22 - Хирурги впервые пересадили человеку генетически модифицированное свиное сердце
14.01.22 - Исследователи научились находить редких животных, «высасывая» их ДНК из воздуха
21.12.21 - Генная терапия вернула слух мышам: дальше лечение протестируют на людях
11.12.21 - Полиция использует секвенирование ДНК для создания фотопортретов преступников
19.11.21 - Ученые придумали, как исправить запутанность в ДНК и лечить редкие заболевания
TOP100 самых популярных
новостей
за месяц
Место Наименование Показов
1

Глобальная сеть стала частью жизни трети россиян

ВЦИОМ выяснил привязанность россиян к Интернету. Глобальной сетью регулярно пользуются 38 процентов россиян, из которых 23 процента выходят в Интернет ежедневно, а 11 процентов - еженедельно. ВЦИОМ в

180
2

Астрофизики обнаружили пригодную для экстремофилов суперземлю

Европейские астрономы обнаружили суперземлю в зоне, потенциально пригодной для обитания, вокруг звезды Gliese 163 на расстоянии 50 световых лет от Земли. Статья ученых подана в журнал Astronomy and As

148
3

Европейские операторы массово заказывают nano-SIM-карты

Согласно данным Financial Times, европейские операторы массово размещают заказы на nano-SIM-карты. Подобный ажиотаж ресурс связывает с близящимся анонсом следующей версии смартфона iPhone, который, по

130
4

Резину изобрели и активно использовали 3500 лет назад

  Доиспанские народы не только придумали резину, но и с целью повышения свойств резины усовершенствовали систему химической обработки каучука. Результатом была износостойкая резина для подошв сандалий

110
5

Магнитное поле превратило наночастицы в кольца Cатурна

Команда исследователей "научила" наночастицы собираться в сложные пространственные структуры. Ученые смогли получить цветы и кольца Сатурна в наномасштабе, используя частицы с различными магнитными св

106

Анонсы событий